Le Fonds met essentiellement l'accent sur le voisinage européen (Partenariat oriental et région du Moyen-Orient et de l'Afrique du Nord), les Balkans occidentaux et la Turquie. Les pays de la région voisine de l'Est pouvant prétendre à une aide sont : Arménie, Azerbaïdjan, Biélorussie, Géorgie, Moldavie et Ukraine. Les pays de la région voisine du Sud pouvant prétendre à une aide sont : Algérie, Égypte, Jordanie, Libye, Liban, Maroc, Palestine, Syrie et Tunisie.

En 2015, le mandat du Fonds a été étendu afin de pouvoir accéder aux demandes de subvention émanant de pays situés dans la région adjacente au voisinage, en fonction des besoins, des fonds disponibles et des priorités politiques. Ces pays sont : le Bahreïn, le Tchad, l'Iran, l'Iraq, Israël, le Koweït, le Mali, la Mauritanie, le Niger, Oman, le Qatar, l'Arabie saoudite, le Soudan et les Émirats arabes unis, ainsi que le Kazakhstan, le Kirghizistan, la Russie, le Tadjikistan le Turkménistan et l'Ouzbékistan. En 2018, le Fonds étendait une fois de plus ses opérations afin d'inclure la Turquie et les Balkans occidentaux : l'Albanie, la Bosnie-Herzégovine, le Kosovo, l'ancienne république yougoslave de Macédoine, le Monténégro et la Serbie. Le FEDEM pourrait à l'avenir étudier les demandes émanant d'autres pays selon les fonds disponibles.

L'initiative candidate ne doit pas impérativement être implantée dans l'un des pays cités mais les activités proposées doivent généralement bénéficier aux populations de ces pays et impliquer des acteurs issus de ces pays.